ردیابی قارچ verticillium dahliae از خاک و ریشه با استفاده از تکنیک های مبتنی بر pcr

thesis
abstract

هدف از این پژوهش دستیابی به یک روش دقیق و حساس با کوتاه ترین زمان ممکن برای ردیابی بیمارگر از خاک و اندام های آلوده گیاهی است. در این پژوهش از خاک و ریشه درختان زیتون و زردآلو آلوده به بیمارگر، 16 جدایه v. dahliae جداسازی و خالص سازی شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی در چرخه nested-pcr شناسایی مورفولوژیکی جدایه ها تایید گردید. برای تعیین مناسب ترین روش ردیابی بیمارگر از خاک و ریشه از سه روش محیط کشت نیمه انتخابی، گیاه تله و روش مولکولی nested-pcr استفاده گردید. روش گیاه تله به دلیل زمان بر بودن و عدم حساسیت و دقت لازم جهت ردیابی بیمارگر مناسب تشخیص داده نشد. استفاده از محیط کشت به روش ظرف وارکوپ در مدت زمان طولانی قادر به ردیابی بیمارگر از خاک بود، اما تکنیک nested-pcr به دلیل حساسیت و دقت بالا جهت ردیابی بیمارگر درکوتاه ترین زمان ممکن به روش بهتر ارزیابی گردید. بررسی میزان مایه تلقیح اولیه و مدت زمان لازم برای ردیابی بیمارگر نشان داد که دمای خاک در ردیابی بیمارگر نقش دارد. در خاک های لومی دارای دو درصد ماده آلی فاقد میزبان با افزایش مایه تلقیح اولیه مدت زمان لازم برای ردیابی بیمارگر کاهش یافت و با نوسانات دمای خاک جهت رشد قارچ در مدت زمان طولانی ردیابی بیمارگر امکان پذیر شد. همچنین در تعیین حساسیت چرخه nested-pcrبرای ردیابیdna بیمارگر مشخص شد که با وجود عوامل بازدارنده در خاک، غلظتdna موجود در خاک آلوده در رقت بیشتر از gm/ gn2/1 قابل ردیابی است. به منظور تایید صحت ردیابی عامل پژمردگی با جدایه v. dahliae از خاک و ریشه، محصول nested-pcr تعیین توالی نوکلئوتیدی گردید. نتایج همردیف سازی دوتایی توالی شناخته شده با توالی v. dahliae موجود در بانک ژن 98 درصد شباهت نشان داد که نشانه صحت ردیابی بیمارگر از خاک به روش nested-pcr بود. با توجه به نتایج بدست آمده، چنین بنظر می رسد که استفاده از روش nested-pcr برای ردیابی v. dahliae از خاک، روش کارآمدی می باشد.

similar resources

کمیت سنجی قارچ Verticillium dahliae در ریشه چهار رقم زیتون با استفاده از تکنیک Real- time PCR

پژمردگی ورتیسلیومی یکی از بیماری¬های مهم زیتون است که با تخریب آوندها باعث خشکیدگی شاخهها، کاهش عملکرد و در نهایت مرگ درختان بیمار میشود. در این تحقیق ابتدا از درختان زیتون مشکوک به پژمردگی ورتیسیلیومی در منطقه طارم در استان زنجان نمونه برداری شد. پس از کشت و خالص سازی قارچ، استخراج دی ان اِ با روش سی تب انجام شد . برای ارزیابی واکنش ارقام زیتون، ریشه نهال¬های پنج ماهه ارقام زرد ، آربیکن، آبلونک...

full text

تعیین پاتوتیپ‌های قارچ Verticillium dahliae عامل بیماری پژمردگی ورتیسلیومی در باغات زیتون طارم با استفاده از تکنیک Nested-PCR

پژمردگی ورتیسیلیومی یکی از بیماری­های مهم زیتون می­باشد که توسط گونه   Verticillium dahliaeایجاد می شود. عامل بیماری با تخریب آوندها باعث خشکیدگی شاخه­ها، کاهش عملکرد و در نهایت مرگ درختان بیمار می­شود. جدایه­های قارچ عامل بیماری، با وجود تشابه ظاهری، از نظر علایم و شدت بیماری­زایی در دو گروه متمایز تحت عنوان پاتوتیپ­های برگ­ریز (Defoliating) و غیر برگ­ریز (Non-defoliating) دسته بندی می­شوند. ش...

full text

کمیت سنجی قارچ verticillium dahliae در ریشه چهار رقم زیتون با استفاده از تکنیک real- time pcr

پژمردگی ورتیسلیومی یکی از بیماری¬های مهم زیتون است که با تخریب آوندها باعث خشکیدگی شاخهها، کاهش عملکرد و در نهایت مرگ درختان بیمار میشود. در این تحقیق ابتدا از درختان زیتون مشکوک به پژمردگی ورتیسیلیومی در منطقه طارم در استان زنجان نمونه برداری شد. پس از کشت و خالص سازی قارچ، استخراج دی ان اِ با روش سی تب انجام شد . برای ارزیابی واکنش ارقام زیتون، ریشه نهال¬های پنج ماهه ارقام زرد ، آربیکن، آبلونک...

full text

تعیین پاتوتیپ های قارچ verticillium dahliae عامل بیماری پژمردگی ورتیسلیومی در باغات زیتون طارم با استفاده از تکنیک nested-pcr

پژمردگی ورتیسیلیومی یکی از بیماری­های مهم زیتون می­باشد که توسط گونه   verticillium dahliaeایجاد می شود. عامل بیماری با تخریب آوندها باعث خشکیدگی شاخه­ها، کاهش عملکرد و در نهایت مرگ درختان بیمار می­شود. جدایه­های قارچ عامل بیماری، با وجود تشابه ظاهری، از نظر علایم و شدت بیماری­زایی در دو گروه متمایز تحت عنوان پاتوتیپ­های برگ­ریز (defoliating) و غیر برگ­ریز (non-defoliating) دسته بندی می­شوند. ش...

full text

ردیابی قارچ aspergillus flavus با استفاده از تکنیک های مبتنی بر pcr

آلودگی پسته به قارچ aspergillus flavus و زهرابه آفلاتوکسین از اهمیت بهداشتی و اقتصادی زیادی برخوردار است. علاوه بر این قارچ مذکور روی گستره وسیعی از محصولات کشاورزی و مواد غذایی رشد می نماید و با تولید متابولیت های ثانویه مانند آفلاتوکسین موجب آلودگی آنها می شود. آفلاتوکسین به عنوان یکی از سمی ترین متابولیت های قارچی شناخته شده است، و در انسان و حیوانات باعث بروز سرطان خصوصا سرطان کبدی می شود. ...

ردیابی سریع Armillaria mellea عامل پوسیدگی ریشه و طوقه درختان از نمونه های خاک و چوب با استفاده از تکنیک PCR آشیانه ای

بیماری پوسیدگی آرمیلاریایی ریشه و طوقه که توسط گونه­های Armillaria ایجاد می­شود، یکی از بیماری­های مهم گیاهان چوبی اعم از درختان میوه، جنگلی و زینتی در مناطق مختلف می­باشد. این بیماری در استان اصفهان به شدت شیوع دارد و همه ساله خسارت فراوانی را به درختان میوه وارد می­سازد. از آنجا که در میان درختان میوه تعداد کمی رقم مقاوم به بیماری یافت می­شود و هیچ اقدام موثری نیز در کنترل کامل بیماری وجود ند...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - دانشکده علوم کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023